В 1951 году в Институте экспериментальной патологии и терапии рака Академия медицинских наук СССР, правопреемником которого является  ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина» Минздрава России, создается научно-организационный отдел, который также отдел проводил работу по подготовке специалистов-онкологов и повышению квалификации в области онкологии среди врачей общей лечебной сети.
После нескольких преобразований в 2020 году сформирован Департамент профессионального образования, куда входят:

• Методический образовательный отдел;
• Кафедра последипломного образования врачей;
• Многофункциональный симуляционно-тренинговый аккредитационный центр;
• Научно-медицинская библиотека.

В соответствии с лицензией на осуществление образовательной деятельности (регистрационный номер № Л035-00115-77/00096121, срок действия лицензии - бессрочно), выданной 22 февраля 2018 года, и свидетельством о государственной аккредитации образовательной деятельности (серия 90А01 № 0003763, регистрационный номер № 3543, срок действия государственной аккредитации - бессрочно), выданным 09 апреля 2021 года, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России осуществляет образовательную деятельность  по подготовке кадров высшей квалификации по программам аспирантуры и ординатуры, а также в области дополнительного профессионального образования. 

Подготовка научных и научно-педагогических кадров в аспирантуре осуществляется по 3 научным специальностям:

Подготовка обучающихся ведется в современных аудиториях, оборудованных компьютерной и мультимедийной техникой, а также в отделениях и клинических подразделениях оснащенных самым современным диагностическим и лечебным оборудованием.

Выпускники ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина» Минздрава России, являясь грамотными и конкурентоспособными специалистами, пользуются неизменной востребованностью в научно-исследовательских институтах и учреждениях практического здравоохранения России и зарубежных стран.